Struktur organisasi Kantor Imigrasi Kelas II Non TPI Dabo Singkep dipimpin oleh Kepala Kantor Imigrasi dibantu Subbagian Tata Usaha, Seksi Dokumen dan Izin Tinggal Keimigrasian, Seksi Teknologi Informasi dan Komunikasi Keimigrasian, Seksi Intelijen dan Penindakan Keimigrasian.